Die Bayerische Fördergemeinschaft für Sport in Schule und Verein hat im Frühjahr 2013 eine Best-Practice-Initiative zum sportorientierten Ganztag ins Leben gerufen – mit dem Ziel, durch zusätzliche sportliche Angebote unsere Schulen und das Schulleben zu bereichern. Unter den eingegangenen Bewerbungen wurden von einer Jury 12 Schulen aller Schularten aus ganz Bayern ausgewählt, die im Zeitraum vom Frühjahr 2013 bis zum Sommer 2015 Konzepte und Beispiele eines sportorientierten Ganztags erarbeiten und durch eine Dokumentation anderen Schulen zugänglich machen. Im niederbayerischen Bezirk sind nur 4 Schulen bestimmt worden, davon ist das St.-Gotthard-Gymnasium als einziges Gymnasium in Niederbayern vertreten.
Der Sportunterricht findet in den verschiedenen Jahrgangsstufen wie in der Gymnasialen Schulordnung (GSO) statt.
Vielzahl an NEIGUNGSGRUPPEN und in der AKTIVPHASE im Bereich des Ganztagsgymnasiums, die von verschiedenen Lehrkräften aus dem Kollegium angeboten werden:
z.B. Tischtennis, Fußball (Jungen, Mädchen), Jonglieren, Tennis, Tischtennis, Basketball, Badminton, Rock'n Roll, Klettern, Entspannen, Billard, Sport/Spiel/Spass
Dank der Sportarbeitsgemeinschaften kann das sportive Basisangebot in der Breite wie in der Tiefe erweitert werden.
Bewegungsangebote im Rahmen der „Woche der Gesundheit": z.B. Mentale Fitness in Kooperation mit der AOK Deggendorf, MentalTOP in Kooperation mit der Gesundheitsakademie in Mainburg
Schullandheim in der 5. Jahrgangsstufe mit sportiven Angeboten
Skitage in der 6. Jahrgangsstufe: Ski alpin, Snowboard, ggf. Langlauf
Wintersportwoche in der 7. Jahrgangsstufe: Ski alpin, Snowboard, Alternativgruppe
Sommerwoche in der 8. Jahrgangsstufe mit sportiven Angeboten